Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fundc1Q9DB70 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fundc1Q9DB70 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fundc1Q9DB70 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms