Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med27Q9DB40 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med27Q9DB40 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med27Q9DB40 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med27Q9DB40 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med27Q9DB40 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med27Q9DB40 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med27Q9DB40 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med27Q9DB40 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Med27Q9DB40 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med27Q9DB40 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms