Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TrmuQ9DAT5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TrmuQ9DAT5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms