Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scp2d1Q9DAH1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scp2d1Q9DAH1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scp2d1Q9DAH1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scp2d1Q9DAH1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scp2d1Q9DAH1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms