Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2al1mQ9DAD9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2al1mQ9DAD9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms