Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmbim4Q9DA39 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmbim4Q9DA39 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms