Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Samd8Q9DA37 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Samd8Q9DA37 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms