Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sgf29Q9DA08 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sgf29Q9DA08 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms