Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D9S1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D9S1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9D9S1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D9S1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D9S1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D9S1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D9S1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9D9S1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms