Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp12Q9D9M2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Usp12Q9D9M2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp12Q9D9M2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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