Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc70Q9D9B0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms