Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx5Q9D8U8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx5Q9D8U8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms