Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SlirpQ9D8T7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SlirpQ9D8T7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms