Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8N1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8N1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8N1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8N1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8N1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9D8N1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8N1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9D8N1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms