Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc52a2Q9D8F3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc52a2Q9D8F3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms