Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tmem54Q9D7S1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem54Q9D7S1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tmem54Q9D7S1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tmem54Q9D7S1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tmem54Q9D7S1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmem54Q9D7S1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmem54Q9D7S1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmem54Q9D7S1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmem54Q9D7S1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmem54Q9D7S1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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