Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisa5Q9D7I0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisa5Q9D7I0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms