Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tnfsf13Q9D777 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnfsf13Q9D777 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms