Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rpap3Q9D706 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpap3Q9D706 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpap3Q9D706 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpap3Q9D706 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpap3Q9D706 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpap3Q9D706 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpap3Q9D706 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpap3Q9D706 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpap3Q9D706 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpap3Q9D706 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpap3Q9D706 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpap3Q9D706 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpap3Q9D706 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpap3Q9D706 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpap3Q9D706 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpap3Q9D706 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms