Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gbe1Q9D6Y9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbe1Q9D6Y9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms