Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc94Q9D6J3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc94Q9D6J3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms