Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra4Q9D6F4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra4Q9D6F4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra4Q9D6F4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra4Q9D6F4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra4Q9D6F4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra4Q9D6F4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra4Q9D6F4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabra4Q9D6F4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabra4Q9D6F4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabra4Q9D6F4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabra4Q9D6F4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabra4Q9D6F4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabra4Q9D6F4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gabra4Q9D6F4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms