Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc81Q9D5W4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc81Q9D5W4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc81Q9D5W4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc81Q9D5W4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms