Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sgms2Q9D4B1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sgms2Q9D4B1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Sgms2Q9D4B1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Sgms2Q9D4B1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sgms2Q9D4B1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sgms2Q9D4B1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sgms2Q9D4B1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sgms2Q9D4B1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Sgms2Q9D4B1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Sgms2Q9D4B1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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