Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syce1Q9D495 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syce1Q9D495 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms