Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gpn3Q9D3W4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpn3Q9D3W4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gpn3Q9D3W4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms