Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tchhl1Q9D3P1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tchhl1Q9D3P1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tchhl1Q9D3P1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tchhl1Q9D3P1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tchhl1Q9D3P1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tchhl1Q9D3P1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tchhl1Q9D3P1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tchhl1Q9D3P1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tchhl1Q9D3P1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tchhl1Q9D3P1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tchhl1Q9D3P1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tchhl1Q9D3P1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tchhl1Q9D3P1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tchhl1Q9D3P1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tchhl1Q9D3P1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tchhl1Q9D3P1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tchhl1Q9D3P1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms