Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx20Q9D2Y5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Snx20Q9D2Y5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Snx20Q9D2Y5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Snx20Q9D2Y5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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