Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tmed11Q9D2R4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tmed11Q9D2R4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tmed11Q9D2R4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tmed11Q9D2R4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tmed11Q9D2R4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tmed11Q9D2R4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tmed11Q9D2R4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Tmed11Q9D2R4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Tmed11Q9D2R4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Tmed11Q9D2R4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Tmed11Q9D2R4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmed11Q9D2R4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms