Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsig1Q9D2J4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsig1Q9D2J4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms