Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Batf3Q9D275 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Batf3Q9D275 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms