Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl34Q9D1R9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl34Q9D1R9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms