Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SarnpQ9D1J3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SarnpQ9D1J3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms