Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
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Zbed3Q9D0L1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zbed3Q9D0L1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Zbed3Q9D0L1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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