Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ssbp3Q9D032 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp3Q9D032 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms