Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prelid3bQ9CYY7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prelid3bQ9CYY7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms