Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc1r1Q9CYQ5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms