Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2fQ9CY34 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2fQ9CY34 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms