Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgo1Q9CXH7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sgo1Q9CXH7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sgo1Q9CXH7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms