Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rpusd4Q9CWX4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd4Q9CWX4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms