Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkrip1Q9CWV6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Prkrip1Q9CWV6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prkrip1Q9CWV6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms