Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CWU4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CWU4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CWU4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CWU4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CWU4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CWU4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9CWU4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CWU4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CWU4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CWU4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms