Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snx2Q9CWK8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx2Q9CWK8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms