Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BccipQ9CWI3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BccipQ9CWI3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BccipQ9CWI3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
BccipQ9CWI3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BccipQ9CWI3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BccipQ9CWI3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BccipQ9CWI3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BccipQ9CWI3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BccipQ9CWI3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BccipQ9CWI3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BccipQ9CWI3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BccipQ9CWI3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BccipQ9CWI3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms