Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Sycp2Q9CUU3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Sycp2Q9CUU3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Sycp2Q9CUU3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Sycp2Q9CUU3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms