Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl28Q9CR40 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Klhl28Q9CR40 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Klhl28Q9CR40 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms