Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM5

Txndc17, Thioredoxin domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc17Q9CQM5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Txndc17Q9CQM5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Txndc17Q9CQM5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms