Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd2aQ9CQJ1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms