Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ergic3Q9CQE7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ergic3Q9CQE7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms