Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms